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Identificación de genes relacionados a la respuesta hidrotrópica en maíz mediante estudios de asociación del genoma completo (genome-wide association studies, gwas)
| dc.rights.license | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 - Atribución-NoComercial | es_MX |
| dc.contributor | DELFEENA EAPEN | es_MX |
| dc.contributor.author | JESUS JONATHAN MARTINEZ GUADARRAMA | es_MX |
| dc.contributor.other | director - Director | es_MX |
| dc.coverage.spatial | MEX - México | es_MX |
| dc.date | 2019-05-28 | |
| dc.date.accessioned | 2019-05-29T11:22:56Z | |
| dc.date.available | 2019-05-29T11:22:56Z | |
| dc.identifier.uri | http://riaa.uaem.mx/handle/20.500.12055/750 | |
| dc.description | Resumen Las plantas tienen la capacidad de dirigir el crecimiento de sus raíces hacia fuentes de humedad, este fenómeno es conocido como hidrotropismo y puede ser utilizado como mecanismo de evasión a la sequía, sin embargo este fenómeno es poco estudiado y a pesar de su potencial aplicación se conoce muy poco en plantas de interés agrícola como el maíz. El objetivo de este trabajo fue identificar genes relacionados a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz a través de análisis de asociación del genoma completo (Genome-Wide Association Studies, GWAS) en una población de 231 híbridos de maíz DTMA (Drought Tolerant Maize for Africa). El análisis tipo GWAS partió de la fenotipificación de la respuesta hidrotrópica y la identificación de SNPs en la población de híbridos DTMA. A partir de estos datos obtenidos se realizó el análisis tipo GWAS, en el cual se identificaron más de 23 mil SNPs asociados a la respuesta hidrotrópica de maíz. Se realizó la búsqueda de información de los 100 SNPs con la mayor asociación (valor P) a dicha respuesta y fueron seleccionados los genes NRT1.1, EGY3, NPH3 y DUF1005 para explorar sus funciones reportadas y posible participación en la vía de señalización de la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz. A través de PCR tiempo final se identificó que DUF1005 se expresa a 6 horas de exposición a un gradiente de humedad in vitro, y de forma diferencial en híbridos con y sin respuesta hidrotrópica. Interesantemente, el SNP con mayor asociación a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz se situó dentro del gen DUF1005. | es_MX |
| dc.format | pdf - Adobe PDF | es_MX |
| dc.language | spa - Español | es_MX |
| dc.publisher | El autor | es_MX |
| dc.rights | openAccess - Acceso Abierto | es_MX |
| dc.subject | 7 - INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA | es_MX |
| dc.subject.other | 33 - CIENCIAS TECNOLÓGICAS | es_MX |
| dc.title | Identificación de genes relacionados a la respuesta hidrotrópica en maíz mediante estudios de asociación del genoma completo (genome-wide association studies, gwas) | es_MX |
| dc.type | masterThesis - Tesis de maestría | es_MX |
| uaem.unidad | Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas (IICBA) - Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas (IICBA) | es_MX |
| uaem.programa | Maestría en Ciencias - Maestría en Ciencias | es_MX |
| dc.type.publication | acceptedVersion | es_MX |
| dc.audience | researchers - Investigadores | es_MX |
Ficheros en el recurso
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Colección Tesis Posgrado
Se trata de tesis realizadas por estudiantes egresados de programas de posgrado de nuestra institución.