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Comparación de transcriptomas de dos poblaciones de Galphimia spp. para identificar posibles genes candidatos que codifican enzimas de la ruta de síntesis de las galfiminas

dc.rights.licensehttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 - Atribución-NoComerciales_MX
dc.contributorMA. LUISA TERESA VILLARREAL ORTEGAes_MX
dc.contributor.authorDIANELLA IGLESIAS RODRÍGUEZes_MX
dc.contributor.otherdirector - Directores_MX
dc.coverage.spatialMEX - Méxicoes_MX
dc.date2022-11-24
dc.date.accessioned2022-12-14T20:18:41Z
dc.date.available2022-12-14T20:18:41Z
dc.identifier.urihttp://riaa.uaem.mx/handle/20.500.12055/3044
dc.descriptionLa calderona amarilla, especie perteneciente al género Galphimia (Malpighiaceae), es una planta muy usada en la medicina tradicional mexicana. Sus propiedades ansiolíticas y sedantes la han convertido en el objetivo de estudios farmacológicos, fitoquímicos, metabolómicos y genéticos. Estas propiedades se deben a la presencia de galfiminas que son compuestos triterpenoides modificados del tipo nor-secofriedelanos. La ruta de síntesis de las galfiminas no se encuentra elucidada aun, aunque existen propuestas biogenéticas no demostradas experimentalmente que han intentado explicar su origen. Debido a que las galfiminas son metabolitos con una actividad biológica ampliamente demostrada, resulta pertinente identificar los genes que codifican las enzimas que intervienen en su ruta de síntesis. La transcriptómica en una herramienta con la cual se pueden estudiar un conjunto de genes que se expresan bajo una condición o estímulo específico, por lo que un análisis de esta clase permitiría identificar los posibles genes implicados en la ruta de síntesis de las galfiminas. El objetivo de este trabajo fue comparar transcriptomas de dos poblaciones de Galphimia spp., una productora y otra no productora de galfiminas, para identificar los posibles genes candidatos relacionados con la ruta de síntesis de estos triterpenoides. Plantas de las dos poblaciones fueron cultivadas bajo condiciones semicontroladas de temperatura y humedad relativa. Se determinó la presencia de galfiminas en los extractos metanólicos de plantas de ambas poblaciones mediante cromatografía en capa fina y cromatografía líquida de alta eficiencia. Se secuenciaron librerías de cDNA en la plataforma Illumina Next Seq 550. Se realizó la anotación funcional de los transcriptomas ensamblados en términos de ontología génica en tres niveles: proceso biológico, función molecular y componente celular. Se realizó un análisis de expresión diferencial con la librería edgeR. Se identificaron posibles genes candidatos relacionados con la síntesis de galfiminas y se construyó una red de co-expresión para establecer relaciones entre los transcritos que codificaron enzimas relacionadas con la síntesis de terpenos. Se validaron los resultados del análisis transcriptómico mediante una PCR cuantitativa. Las plantas de Galphimia spp. obtenidas de ambas poblaciones presentaron los caracteres fenotípicos descritos para este género.es_MX
dc.formatpdf - Adobe PDFes_MX
dc.languagespa - Españoles_MX
dc.publisherEl autores_MX
dc.rightsopenAccess - Acceso Abiertoes_MX
dc.subject6 - CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍAes_MX
dc.subject.other31 - CIENCIAS AGRARIASes_MX
dc.titleComparación de transcriptomas de dos poblaciones de Galphimia spp. para identificar posibles genes candidatos que codifican enzimas de la ruta de síntesis de las galfiminases_MX
dc.typedoctoralThesis - Tesis de doctoradoes_MX
uaem.unidadCentro de Investigación en Biotecnología (CEIB) - Centro de Investigación en Biotecnología (CEIB)es_MX
uaem.programaDoctorado en Ciencias Naturales - Doctorado en Ciencias Naturaleses_MX
dc.type.publicationacceptedVersiones_MX
dc.audienceresearchers - Investigadoreses_MX
dc.date.received2022-11-21


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  • Colección Tesis Posgrado [2717]
    Se trata de tesis realizadas por estudiantes egresados de programas de posgrado de nuestra institución.

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